L'aeroporto di Girona ha circa 2000 posti macchina divisi in tre aree parcheggio denominate P1, di 860 posti auto e di fronte il Terminal, P2 e P3. Questi parcheggi sono controllati 24 ore su 24.
Dal momento del pagamento, presso le casse automatiche, si hanno 15 minuti per ritirare la propria auto e uscire.